毕业论文查重的真正效果是一个备受争议的话题。在当前网络信息高度发达的时代，学术诚信和知识创新已成为学术界和社会关注的焦点。论文查重系统作为一种检测学术不端行为的工具，被广泛应用于各大高校和科研机构。然而，其真正效果究竟是什么，目前尚无统一的共识。

论文查重系统主要通过比对文本的相似度来判断是否存在抄袭行为，为维护学术诚信提供了一定的保障。可以有效减少学术抄袭和剽窃现象的发生，提高学术界的整体水平和声誉。论文查重系统还可以发现自己文献的不足之处，促使其加强对相关领域文献的学习，从而推动知识的传播和创新。

论文查重系统也存在一些局限性和缺陷。系统的匹配算法并非完全准确，可能会产生误判，给一些学术正当参考带来不必要的困扰和误解。对于一些特殊领域和文本形式，系统的检测能力并不十分完善，容易造成漏检等问题。一些不法分子也可能针对系统的漏洞进行技术破解，从而绕过查重的监管。

综上所述，毕业论文查重系统作为一种学术管理和监督的手段，在一定程度上能够有效预防学术不端行为的发生，维护学术诚信和学术界的发展。然而，为了发挥其真正的效果，我们需要不断改进系统的技术和算法，提高检测的准确性和全面性，同时也需要倡导学者们自觉遵守学术规范，从根本上杜绝学术不端现象的发生。只有这样，才能真正实现论文查重系统的最终价值和意义。