关于毕业论文中化学公式是否会被查重的问题，答案是通常不会。查重系统的主要目标是检测文字部分的重复率，而不是公式本身。

目前高校普遍使用的查重系统，其核心工作原理是对文本进行比对。系统会将你提交的论文电子版分解成连续的文字片段，与数据库中的海量文献进行匹配。它关注的是字符的排列组合是否一致。

化学公式，无论是简单的分子式如 H₂O，还是复杂的化学反应方程式，在系统中大多被视为一种特殊的“图形”或“符号序列”。系统没有能力去理解一个公式的化学含义，它只会判断公式的“样子”。如果两个公式在排版上完全一样，比如都使用了相同的上下标、箭头和字体，系统可能会在物理形态上判定为相似。但这种情况非常少见，因为同一个公式存在多种规范且等价的表达方式。例如，反应条件的标注位置稍有不同，在系统看来就是两个不同的“图形”，也就不会算作重复。

真正需要担心的是描述公式的文字部分。比如，你在公式后面跟着一段解释性的文字：“该反应为可逆反应，在催化剂作用下达到平衡。” 这句话如果直接复制自其他文献，就一定会被查重系统标红。公式是通用的科学语言，但你对公式的引入、说明、分析和讨论，必须是自己的语言组织起来的。

有些同学可能会把公式以图片的形式插入论文中。这种做法确实能“绕过”查重系统的文本识别，因为系统通常无法识别图片里的内容。但并不推荐这样做。主要原因有两点：一是图片格式可能会影响论文整体的排版美观和规范性；二是毕业论文作为学术作品，需要保持内容的一致性，全文的公式最好采用统一的编辑方式（比如使用公式编辑器），突然插入图片会显得不协调。更重要的是，导师和答辩专家一眼就能看出区别，可能会认为你态度不够严谨。

正确的做法是放心使用公式编辑器（如Mathtype或Word自带编辑器）来规范地撰写文中的化学公式。你需要投入精力的地方，是确保所有围绕公式产生的文字内容都是原创的。这意味着，你不能直接照搬教科书或参考文献里对某个公式的现成描述。你得用自己的话，把公式的来龙去脉、在本次实验中的意义、以及它如何支持你的结论讲述清楚。

公式本身是安全的，但包裹着公式的文字环境才是查重的风险区。你的创新点和学术价值主要体现在这些文字分析上，而不是体现在公式的罗列上。把公式当作一个客观的工具，把思考的重点放在如何用这个工具讲好自己的研究故事，这样就能有效避免重复率过高的问题。